Năm 2012, các cấp, các ngành trong tỉnh đã thực hiện có hiệu quả nhiệm vụ công tác Biên phòng; an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội khu vực biên giới biển và vùng nước cảng được đảm bảo. Lực lượng bộ đội Biên phòng tỉnh từng bước được củng cố, kiện toàn về mọi mặt, nỗ lực phấn đấu hoàn thành tốt nhiệm vụ, xứng đáng là lực lượng nòng cốt, chuyên trách trong quản lý, bảo vệ chủ quyền, an ninh biên giới vùng biển.
Tuy nhiên, trong tổ chức thực hiện nhiệm vụ công tác Biên phòng năm 2012 vẫn còn một số tồn tại, hạn chế, đó là: Nhận thức của một bộ phận cán bộ, nhân dân về nhiệm vụ công tác Biên phòng chưa đầy đủ; công tác tham mưu, đề xuất với cấp ủy, chính quyền, xây dựng lực lượng bộ đội Biên phòng tỉnh trong sạch, vững mạnh có mặt còn hạn chế.
Năm 2013, bên cạnh những thuận lợi cơ bản, tình hình thế giới, khu vực, đặc biệt là tranh chấp chủ quyền, quyền chủ quyền trên Biển Đông tiếp tục diễn biến phức tạp, khó lường, các thế lực thù địch đẩy mạnh các hoạt động "diễn biến hòa bình", "bạo loạn lật đổ" nhằm chống phá cách mạng nước ta. Khu vực biên giới biển và vùng nước cảng của tỉnh vẫn còn tiềm ẩn những nhân tố có thể gây mất ổn định về an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội nếu các cấp, các ngành, các đoàn thể lơ là mất cảnh giác, xử lý không kịp thời, không đúng chủ trương, chính sách của Đảng, quy định của Nhà nước.
Để thực hiện tốt nhiệm vụ công tác Biên phòng năm 2013, Ban Thường vụ Tỉnh ủy yêu cầu các cấp ủy đảng, chính quyền, thủ trưởng các sở, ban, ngành, đoàn thể từ tỉnh đến cơ sở tập trung lãnh đạo, chỉ đạo thực hiện tốt một số nhiệm vụ chủ yếu sau:
1. Tiếp tục quán triệt, triển khai thực hiện nghiêm túc Nghị định số 06/2007/NĐ-CP, ngày 12-1-2007 của Chính phủ về phối hợp giữa Bộ Công an và Bộ Quốc phòng trong chỉ đạo, hướng dẫn Bộ đội Biên phòng và lực lượng Công an nhân dân thực hiện nhiệm vụ bảo vệ an ninh trật tự, an toàn xã hội ở khu vực biên giới; Nghị định số 77/2012/NĐ-CP, ngày 12-7-2010 của Chính phủ về phối hợp giữa Bộ Công an và Bộ Quốc phòng trong nhiệm vụ bảo vệ chủ quyền an ninh Quốc gia, giữ gìn trật tự, an toàn xã hội và nhiệm vụ quốc phòng; Chương trình hành động số 27-CTr/TU, ngày 28-7-2010 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy "Thực hiện Nghị quyết số 28-NQ/T.Ư của Bộ Chính trị (khóa X) về tiếp tục xây dựng các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương thành khu vực phòng thủ vững chắc trong tình hình mới"; Nghị quyết số 01-NQ/TU, ngày 27-9-2011 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy "Về tăng cường sự lãnh đạo của các cấp ủy đảng đối với công tác quân sự, quốc phòng địa phương giai đoạn 2011-2015".
2. Tích cực tuyên truyền, phổ biến, giáo dục pháp luật về biên giới Quốc gia, về chủ quyền biển đảo của Tổ quốc. Tổ chức các hoạt động thiết thực hướng tới kỷ niệm 25 năm "Ngày Biên phòng toàn dân" và 55 năm ngày truyền thống Bộ đội Biên phòng (3-3-1959 - 3-3-2014); tuyên truyền về tình hình, chủ trương, quan điểm chỉ đạo của Đảng, Nhà nước ta đối với vấn đề Biển Đông hiện nay, để qua đó góp phần nâng cao nhận thức, trách nhiệm của các cấp, các ngành, của cán bộ, nhân dân trong xây dựng, bảo vệ biên giới Quốc gia. Xây dựng khu vực biên giới và xây dựng lực lượng Bộ đội Biên phòng tỉnh vững mạnh toàn diện.
3. Bộ đội Biên phòng tỉnh phát huy tốt vai trò nòng cốt, chuyên trách trong quản lý, bảo vệ chủ quyền, an ninh biên giới, vùng biển và chủ trì trong công tác quản lý, kiểm soát xuất, nhập cảnh. Phối hợp chặt chẽ với các địa phương, các cơ quan, đơn vị hữu quan triển khai đồng bộ, toàn diện các biện pháp công tác Biên phòng, đấu tranh có hiệu quả với âm mưu "diễn biến hòa bình" của các thế lực thù địch, các hoạt động tình báo, gián điệp, vi phạm chủ quyền, lãnh thổ vùng biển; hoạt động buôn lậu, gian lận thương mại, phá hoại môi trường biển; hoạt động lợi dụng tôn giáo, tín ngưỡng gây ảnh hưởng xấu đến an ninh trật tự khu vực biên giới biển. Phối hợp chặt chẽ với các đơn vị Quân đội đóng quân trên địa bàn làm tốt công tác phòng, chống lụt bão, tìm kiếm cứu nạn.
4. Tiếp tục đẩy mạnh việc "Học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh và lời dạy của Bác Hồ đối với Bộ đội Biên phòng", nâng cao ý thức trách nhiệm, phẩm chất, năng lực công tác của cán bộ, chiến sỹ Bộ đội Biên phòng. Quan tâm củng cố, kiện toàn tổ chức, biên chế và tạo điều kiện hỗ trợ kinh phí, trang thiết bị để các đơn vị Bộ đội Biên phòng tỉnh hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao.
5. Xây dựng Đảng bộ Biên phòng tỉnh trong sạch, vững mạnh, có sức chiến đấu cao, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ trong tình hình mới. Thực hiện tốt công tác phối hợp lãnh đạo công tác Biên phòng với Thành ủy Ninh Bình, Huyện ủy Kim Sơn và Huyện ủy Yên Khánh.
Các huyện ủy, thành ủy, thị ủy, đảng ủy trực thuộc tỉnh, các Ban cán sự đảng, Đảng đoàn, các sở, ban, ngành, đoàn thể ở tỉnh có trách nhiệm lãnh đạo tổ chức thực hiện nghiêm Chỉ thị này. Đảng ủy Biên phòng tỉnh chủ trì, phối hợp với Văn phòng Tỉnh ủy giúp Ban Thường vụ Tỉnh ủy theo dõi, đôn đốc, kiểm tra và tổng hợp báo cáo kết quả việc thực hiện Chỉ thị về Ban Thường vụ Tỉnh ủy.
Chỉ thị này được phổ biến đến tận chi bộ.