Trường THCS Ninh Khánh tiền thân là Trường cấp II quốc lập đầu tiên của huyện Gia Khánh, được thành lập vào tháng 9-1959 tại khu Đình Sen, thôn Đái Nhân, xã Ninh Khánh, huyện Gia Khánh (nay là phường Ninh Khánh, thành phố Ninh Bình).
50 năm qua, quy mô nhà trường ngày một phát triển, chất lượng giáo dục ngày càng nâng cao. Năm học 2008-2009, Trường có 12 lớp, gần 500 học sinh, 32 cán bộ, giáo viên. Tỷ lệ học sinh tốt nghiệp lớp 9 đạt 98,4%, 1 học sinh đạt giải Quốc gia, 27 học sinh đạt giải cấp tỉnh, thành phố. Cơ sở vật chất nhà trường được đầu tư xây dựng khang trang, sạch đẹp với 17 phòng học kiên cố cao tầng và các phòng chức năng. Trường đã đào tạo được hàng chục nghìn học sinh, nhiều người thành đạt trên các lĩnh vực công tác, đóng góp tích cực vào công cuộc bảo vệ, xây dựng quê hương, đất nước.
Từ khi thành lập đến nay, Trường liên tục đạt danh hiệu tiên tiến và tiên tiến xuất sắc; chi bộ Đảng liên tục đạt trong sạch, vững mạnh; Liên đội luôn là một điểm sáng về hoạt động Đội của ngành Giáo dục - đào tạo Ninh Bình.
Với những thành tích đạt được, Trường THCS Ninh Khánh đã được Chủ tịch nước tặng thưởng Huân chương Lao động hạng Nhất và là đơn vị đầu tiên được UBND tỉnh công nhận Trường đạt chuẩn Quốc gia khối THCS của tỉnh.
Trong thời gian tới, nhà trường tiếp tục thực hiện tốt yêu cầu đổi mới chương trình, nội dung, phương pháp giáo dục, tập trung nâng cao chất lượng giáo dục toàn diện; chú trọng giáo dục đạo đức, lối sống, giáo dục hướng nghiệp, pháp luật cho học sinh; các thầy, cô giáo tích cực học tập nâng cao trình độ chuyên môn, nghiệp vụ, sáng tạo trong giảng dạy; học sinh nhà trường noi gương các thế hệ đi trước, chăm chỉ học tập, tu dưỡng đạo đức, viết tiếp trang sử vẻ vang cho mái trường 50 năm tuổi.
Thanh Hà